研究报告/Research Report

陆地棉(Gossypium hirsutum)光敏色素B基因(GhPHYB)克隆及其生物信息学分析  

李建平1,2 , 郝晓燕2 , 陈勋基2 , 陈果2 , 罗城2 , 刘海峰1 , 黄全生2
1 中国彩棉(集团)股份有限公司,乌鲁木齐,830023;
2 新疆农业科学院核技术生物技术研究所,乌鲁木齐, 830091
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 8 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001725
收稿日期: 2015年06月09日    接受日期: 2015年07月03日    发表日期: 2015年08月17日
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推荐引用:

Li J.P., Hao X.Y., Chen X.J., Chen G., Luo C., Liu H.F., and Huang Q.S., 2015, Cloning and bioinformatics analysis of phytochrome B gene (GhPHYB) from Gossypium hirsutum, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(8): 1725-1729 (李建平, 郝晓燕, 陈勋基, 陈果, 罗城, 刘海峰, 黄全生, 2015, 陆地棉(Gossypium hirsutum)光敏色素B基因(GhPHYB)克隆及其生物信息学分析, 分子植物育种,13(8): 1725-1729)

摘要

本研究依据已公布的雷蒙德氏棉基因组测序结果,采用同源克隆的方法,以陆地棉TM-1幼苗为材料,利用RT-PCR技术克隆得到陆地棉光敏色素B基因(GhPHYB)的cDNA序列。结果显示:该基因ORF全长3 582 bp,编码1 194个氨基酸;通过与已知的拟南芥光敏色素B氨基酸序列比对及蛋白结构预测,发现该基因包含植物光敏色素完整的结构,与烟草、拟南芥、水稻、小麦和玉米的氨基酸序列相似性分别为87.2%、77.9%、74.5%、74.5%和54.6%。同时,本研究还构建了GhPHYB基因的RNAi干涉载体用于转化棉花,并通过构建棉花PHYB RNAi突变体了解陆地棉PHYB基因对棉花株型、开花期、产量、棉纤维品质、抗逆性等方面的调控作用。研究结果可为该基因今后应用于棉花生产奠定基础。

关键词
陆地棉;光敏色素B;克隆;RNAi干涉

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《分子植物育种》印刷版
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