研究报告/Research Report

库尔勒香梨上苹果茎沟病毒全序列的鉴定与分析  

孙晓霞1,2 , 牛建新1,2 , 王博慧1,2 , 裴茂松1,2 , 李陈静1,2 , 曹福军1,2
1石河子大学农学院园艺系, 石河子, 832003;
2特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室, 石河子, 832003
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 14 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001771
收稿日期: 2015年01月08日    接受日期: 2015年02月25日    发表日期: 2015年06月29日
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推荐引用:

Sun X.X., Niu J.X., Wang B.H., Pei M.S., Li C.J., and Cao F.J., 2015, Identification and analysis of an Apple Stem Groove Virus complete genomic sequence from korla fragrant fear, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(8): 1771-1778 (孙晓霞, 牛建新, 王博慧, 裴茂松, 李陈静, 曹福军, 库尔勒香梨上苹果茎沟病毒全序列的鉴定与分析, 分子植物育种, 13(8): 1771-1778)

摘要

本研究以新疆库尔勒香梨园随机选取的三棵香梨树花朵为试验材料,采用Illumina HiSeq/MiSeq测序技术分离得到1个库尔勒香梨上的苹果茎沟病毒分离物ASGV-kfp的全长序列。序列分析结果显示:该分离物基因全长6 460 bp (ASGV-kfp, KR106996),包含3个完整的ORF,分别编码polyprotein、MP基因(Movement protein gene)、CP基因(Trichovirus coat protein gene)。ASGV-kfp的CP基因和MP基因与国内外已报道的该病毒的CP基因和MP基因序列同源性分别达到了93%~99%和97%~100%。进化树分析显示,ASGV的CP基因分子变异与寄主以及地理区域没有相关性;ASGV的MP基因分子变异与寄主有一定的相关性。研究结果可为进一步研究ASGV株系分化奠定良好基础。


 

关键词
苹果茎沟病毒;库尔勒香梨;CP基因;MP基因

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《分子植物育种》印刷版
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