王永行 , 武悦 , 杨钦方 , 杜瑞霞 , 刘春晖 , 单飞彪^*

巴彦淖尔市农牧业科学研究所, 农业农村部植物新品种测试(巴彦淖尔)分中心, 巴彦淖尔, 015000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2021年11月26日    接受日期: 2021年12月03日    发表日期: 2022年09月13日

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为了解地笋的基因组信息，本试验通过 Illumina 测序平台对地笋幼苗叶片进行转录组测序共获得29 700 条 Unigene。将获得的 Unigene 分别与 7 大数据库进行比对，最终有 17 548 条 Unigene 获得注释。其中 17 307 条 Unigene 在 Nr 数据库中获得注释，来源物种主要是一品红；与 GO 数据库比对在细胞组分类别、生物进程和分子功能 3 大功能分类中获得 10 555 条 Unigene 注释。与 KOG 数据库比对后获得 9 895 条基因注释，其中主要集中在一般功能预测和翻译后修饰，蛋白转运这两个功能类别。在所有 Unigene 中共检测到 SSR 位点 10 816 个，从单核苷酸重复单元到六核苷酸重复单元均有分布。本研究为开展地笋功能基因挖掘、次生代谢途径解析和遗传多样性分析提供了理论基础。

地笋；转录组；基因注释；SSR