研究论文

马铃薯蔗糖合酶基因家族序列及表达模式分析  

严荣1 , 王芳1,2,3,* , 赵龙1
1青海大学农牧学院, 西宁, 810016; 2 青海省农林科学院, 青海省马铃薯育种重点实验室, 西宁, 810016; 3 青海大学, 青藏高原生物技术教育部 重点实验室, 西北马铃薯教育部工程研究中心, 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室, 西宁, 810016
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2021年11月19日    接受日期: 2021年12月11日    发表日期: 2022年03月28日
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摘要

蔗糖合酶(sucrose synthase, SUS)是一种广泛存在于植物中催化尿苷二磷酸葡糖(UDPG)上的葡萄糖基团转移到果糖上形成蔗糖和尿苷二磷酸(UDP),及可催化逆反应的糖基转移酶。为了解马铃薯SUS基因家族成员序列分析,及其在非生物胁迫和激素处理下的调控模式,本研究从马铃薯基因组中获取到6个马铃薯SUS基因家族成员。采用相应的生物信息学软件对其进行蛋白理化性质、保守蛋白结构域、基因结构、染色体定位、系统进化树构建、顺式作用元件预测、利用qRT-PCR对非生物胁迫(干旱、高温、低温、盐)和脱落酸(ABA)、生长素(IAA)、赤霉素(GA3)三种激素诱导下的表达模式进行了分析。马铃薯SUS家族蛋白长度为803-892个氨基酸,分子量介于92607.56-100746.25kD之间,等电点的预测在5.91-6.95。其亚细胞定位预测在叶绿体,染色体定位分布于2、3、7、9和12号染色体上。与禾本科水稻和玉米的亲缘关系较近,且马铃薯SUS家族蛋白序列具有高度保守性。主要有干旱、低温、激素响应元件,qRT-PCR表达模式的分析结果表明蔗糖合酶基因可能参与干旱、低温胁迫调控的途径,受到激素的诱导上调或下调,可推论蔗糖合酶也参与激素调控途径。

关键词
马铃薯;蔗糖合酶; 表达分析; 非生物胁迫;激素诱导

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