研究报告/Research Report

彩色马铃薯类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因(3GT)的生物信息学和表达分析  

肖继坪 , 李 俊 , 郭华春
云南农业大学薯类作物研究所, 昆明, 650201
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 9 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001017
收稿日期: 2015年01月06日    接受日期: 2015年03月03日    发表日期: 2015年05月11日
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推荐引用:

Xiao J.P., Li J., and Guo H.C., 2015, Bioinformatical and expression analysis of UDP-glucose: flavonoid -3-O-glucosyltransferase gene from pigmented potato, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding),13(5): 1017-1026(肖继坪,李俊,郭华春,2015,彩色马铃薯类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因(3GT)的生物信息学和表达分析,分子植物育种,13(5): 1017-1026)

摘要

类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶(3GT)能催化无色的花色素生成有色的花色苷。本研究采用RT-PCR法从彩色马铃薯中克隆了3GT基因,并对其进行了生物信息学分析和组织表达模式分析。结果显示,3GT基因编码448个氨基酸残基,具有信号肽但无跨膜结构域,还有一定的亲水性,定位于细胞质。同源比对表明3GT与茄子等茄科植物同属一簇,亲缘关系最近,与玉米等单子叶植物亲缘关系较远。3GT蛋白主要的二级结构元件为α-螺旋和无规则卷曲,且只有一个功能结构域,即氨基酸序列中的93~407区段,它与UDP-glucoronosyl、UDP-glucosyl transferase的功能结构域相匹配,因此,3GT属于UDPGT型糖基转移酶超家族的一员。组织特异性表达结果表明:3GT相对表达量和花色苷含量均是块茎高于叶片,它们的变化趋势基本一致,花色苷含量较高的器官,其3GT的相对表达量也较高,说明花色苷的积累与3GT的表达正相关。本研究可为花色苷积累的生化及分子机制研究奠定基础,并为进一步研究该基因在花色苷合成途径中的调控功能提供理论依据。

关键词
彩色马铃薯;类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因(3GT;花色苷;序列分析;表达

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《分子植物育种》印刷版
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