郁永明 , 田丹青 , 潘晓韵 , 金亮 , 葛亚英

浙江省农科院花卉研究开发中心, 杭州, 311202
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 22 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001349
收稿日期: 2015年01月06日    接受日期: 2015年02月16日    发表日期: 2015年05月03日

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推荐引用：

Yu Y.M., Tian D.Q., Pan X.Y., Jin L., and Ge Y.Y., 2015, Mining and developing SSR molecular markers based on transcriptome sequences of anthurium, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(6): 1349-1354 (郁永明，田丹青，潘晓韵，金亮，葛亚英，2015，基于红掌转录组序列的SSR标记分析与开发，分子植物育种，13(6): 1349-1354)

本研究从红掌转录组共32 391条unigenes中搜索得到3 944个SSR位点，出现频率为12.17%。EST-SSR类型以一、二、三核苷酸重复为主，占总SSR比例的96.29%，其中二核苷重复为主要基序类型，占总SSR的51.01%，AG/CT重复类型出现最多。设计合成的200对SSR引物中有22对引物扩增条带清晰、多态性好，在18个红掌品种中得到有效性验证。结果表明，基于红掌转录组序列的SSR标记开发是可行的，这些EST-SSR的开发可为红掌遗传多样性分析、分子育种等奠定重要基础。

红掌；转录组；SSR；引物