赵悦¹ , 魏登贤² , 李强峰¹ , 赵艳艳¹

1 青海大学农牧学院, 西宁, 810016; 2 青海省林木种苗总站, 青藏高原林木种质资源国家长期科研基地, 西宁, 810099
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2021年08月12日    接受日期: 2021年08月28日    发表日期: 2022年04月28日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

为了挖掘冷诱导下野生青海茄参的差异表达基因，本试验采用野生青海茄参为供试材料，4 ℃冷诱导处理，对无参转录组青海茄参叶片进行高通量转录组测序。结果显示，Unigene 总数为 73 859 条，N50 长度为 1 818 bp。Transcripts 注释到 NR 的基因数最多，KOG 最少。GO 注释到对胁迫响应(GO: 0006950)的基因数为 1 054 条。KOG 分类中，基因数最多的是翻译、核糖体结构与生物转化，有 2 253 条。野生青海茄参共获得 3 677 个差异表达基因。差异基因 GO 富集分析中，上调表达差异基因主要集中于转移糖基，下调表达差异基因主要集中于生物过程中的细胞氮化合物代谢过程。根据 KEGG 通路分析，上调差异表达基因集中在淀粉和蔗糖的代谢、二苯乙烯、二芳基庚烷和姜酚的生物合成和苯丙素生物合成通路上；富集到 180 个下调差异表达基因于核糖体通路上。冷诱导后，共有 186 个差异表达转录因子，涉及 49 个家族。将对照和处理间表达量方差最大的前 50 个基因做聚类分析，分为两类：第一类有 8 个基因，对照表达量高于处理；第二类有 42 个基因，处理表达量高于对照。该结果为野生青海茄参冷诱导下转录调控机制及抗寒基因挖掘的研究提供依据。

野生青海茄参；冷诱导；转录组；差异表达基因