研究报告

半夏居群遗传多样性及遗传结构分析  

潘凤1 , 莫忠妹2 , 石甜1 , 吴敏1 , 关萍1 , 赵财1*
1 贵州大学生命科学学院, 农业生物工程研究院, 山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室, 山地生态与农业生物工程协同创新中心, 贵阳, 550025; 2 铜仁学院, 贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室, 铜仁, 554300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 39 篇   
收稿日期: 2021年07月23日    接受日期: 2021年07月30日    发表日期: 2022年03月07日
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摘要

为了研究中国野生半夏的遗传多样性及谱系结构,揭示其地理分布格局的形成原因,推测该物种潜在的冰期避难所。对分布于中国 16 个省份 20 个居群(205 个个体)的半夏核基因 ITS 序列进行 PCR 扩增、测序分析。结果发现:在所有的半夏居群中共检测到 14 个单倍型,其中单倍型 H3H6 在居群中分布较广。分子方差分析(AMOVA)结果显示,半夏居群的遗传变异主要发生在居群间(75.83%),居群间遗传分化系数 GST=0.710<NST=0.784 (P>0.05),具有明显的谱系地理结构且基因流较低(Nm=0.019);中性检验结果Tajima's D 0.376 29 (P>0.10)Fu's Fs 值为 -1.883,结合失配分析的单峰曲线分布表明半夏居群近期经历过小范围快速扩张。研究推测,半夏在第四纪冰期时可能存在多个避难所。

关键词
半夏(Pinellia ternata);谱系地理;遗传多样性;nrDNA

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《分子植物育种》印刷版
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