研究报告

水稻‘宜香优 2115’OsZIP3 基因的克隆及序列分析  

王建伟1* , 汤宏1 , 贺晓岚2 , 李秋英2
1凯里学院理学院,凯里, 556011; 2凯里学院大健康学院,凯里, 556011
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2021年07月07日    接受日期: 2021年07月16日    发表日期: 2021年12月21日
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摘要

植物 ZIP (Zn-regulated transporter, Iron-regulated transporter-like protein)家族蛋白是负责吸收、转运和分配 ZnFe等离子的完整膜转运蛋白,对维持植物体内 ZnFe平衡起关键作用,ZIP家族的成员之一OsZIP3参与 Zn分配,OsZIP3 是水稻锌高效相关的备选基因。为了明确OsZIP3 基因在富锌水稻品种中的分子特征,本研究利用 RT-PCR技术从‘宜香优 2115’中克隆到ZIP3 基因,命名为OsZIP3-YXY2115,并对其进行生物信息学分析。序列分析结果表明,该基因的编码区(CDS)全长为 1 095 bp,编码 364个氨基酸,蛋白序列含有 6个跨膜结构,蛋白分子量 38.0 kD,理论等电点 8.67,不稳定指数 42.34,为不稳定蛋白。结构域预测结果显示 OsZIP3-YXY2115蛋白含有 ZIP家族锌铁转运系列结构域,属于锌铁转运蛋白(ZRT/IRT-like protein, ZIP)家族成员。亚细胞定位预测分析表明,OsZIP3-YXY2115蛋白定位于细胞质膜中。氨基酸序列比对结果表明,其与已报道的粳稻OsZIP3 (XP_015635611.1)相似性最高。该研究结果为进一步分析ZIP3 基因功能及作物富锌育种提供了一定的理论基础和基因资源。

关键词
水稻(Oryza sativa L.);锌;OsZIP3 基因;序列分析

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《分子植物育种》印刷版
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