研究报告

白桦 TLP 基因家族生物信息学及组织表达特异性分析  

毕德泷 , 宁小萌 , 孙晶晶 , 冯思雨 , 李然红*
牡丹江师范学院, 生命科学与技术学院, 牡丹江, 157011
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2021年06月15日    接受日期: 2021年06月21日    发表日期: 2022年08月02日
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摘要

为全面了解白桦类甜蛋白(thaumatin-like protein, TLP)基因家族成员的结构、功能和表达特性,本研究采用同源序列比对法,从白桦基因组数据库中筛选并鉴定到 41 个类甜蛋白基因家族成员,分别命名为BpTLP1~BpTLP41,对其进行生物信息学分析,并通过半定量对白桦 TLP 家族成员的组织表达特异性进行了分析。结果表明,41 个白桦类甜蛋白家族成员分别定位在 11 条染色体上,其中 8 号染色体分布最多,包括14 个家族成员。该家族成员的氨基酸数量在 336~975 aa 之间,分子量在 28 054.11~81 966.03 kD 之间,理论等电点在 5.01~5.21 之间,偏酸性。基因半定量结果表明,41 个白桦 TLP 家族成员在根、茎、叶中均有不同程度的表达,其中,BpTLP35BpTLP39 在叶片中表达量较高,BpTLP14BpTLP35BpTLP36 在茎中表达量较高,BpTLP41BpTLP3 在根中表达量较高。

关键词
白桦(Betula platyphylla);类甜蛋白;生物信息学;组织表达

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《分子植物育种》印刷版
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