研究报告

基于转录组测序的苦荞 FtGLT 鉴定与表达分析  

石桃雄* , 汪燕* , 梁成刚** , 关志秀 , 韦春玉 , 付全兰 , 黄娟
贵州师范大学生命科学学院, 荞麦产业技术研究中心, 贵阳, 550001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2021年04月02日    接受日期: 2021年04月09日    发表日期: 2021年09月25日
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摘要

植物糖类转运蛋白家族中 GLT (Glucose transporter)是介导葡萄糖跨膜运输的重要载体。开展苦荞葡萄糖转运蛋白(FtGLT)的生物信息学研究,可为进一步探索 FtGLT 调控生长发育与产量形成提供科学参考。通过基因注释与序列比对分析,在苦荞转录组测序数据库中筛选到 6 GLT 同源基因。FtGLT 序列在2 167~9 707 bp 间,编码 94~558 个氨基酸残基。FtGLT 蛋白间序列的一致性达到 43.44%,说明苦荞 FtGLT蛋白序列相对保守。除 FtPinG68303.01 外,其余 5 FtGLT 蛋白可能位于内质网。结构分析发现,苦荞FtGLT蛋白具有数量不等的跨膜结构域,这与其结构中 α- 螺旋数量密切相关。基于转录组测序,鉴定到 3 FtGLT显著差异表达基因,均在出苗后 15 d 高表达,其余 3 个基因表达量在 510 15 d 变化较小,推测不同FtGLT 基因在茎发育过程中的功能可能存在差异。相关性分析发现,FtPinG68303.01 FtPinG50279.01 呈极显著负相关;FtPinG83070.01 FtPinG89831.01 FtPinG72784.01FtPinG89831.01 FtPinG72784.01 呈极显著或显著正相关,这可为进一步研究苦荞 FtGLT 相互间的功能及其调控葡萄糖运输的分子机制提供依据。

关键词
苦荞;糖转运体;葡萄糖转运蛋白;基因表达模式

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《分子植物育种》印刷版
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