戴晓港 , 房芝馨 , 胡雪纯 , 韩峭子 , 郭瑞瑞 , 谷瑞 , 李淑娴

南京林业大学林学院, 南方杨树工程技术研究中心, 江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室, 南京, 210037
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 21 篇   
收稿日期: 2021年03月31日    接受日期: 2021年04月09日    发表日期: 2022年03月04日

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通过对薄壳山核桃开展全基因组 SSR 位点分析，开发稳定可靠的多态性 SSR 引物，为薄壳山核桃遗传多样性分析、重要性状 QTL 定位、分子标记辅助育种以及良种分子鉴别等研究提供遗传标记信息。本研究采用Misa 软件查找薄壳山核桃基因组微卫星，在 651 Mb 碱基序列中获得 886 119 个 SSR 位点。利用 Primer 3.0在 524 065 个 SSR 位点成功设计了引物。从长度大于 1 Mb 的不同 scaffold 上，随机选取 50 对引物合成，其中 40 对引物可以成功扩增。采用 8 个不同品种的薄壳山核桃进行引物多态性检测，发现重复序列长度≥20 bp的引物多态性达 58.8%，显著高于重复序列长度<20 bp 引物的 31.8%。利用毛细管电泳对聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选的多态性引物进行验证，发现 9%非变性凝胶电泳的分辨率小于 4 bp。本研究构建了薄壳山核桃全基因组 SSR 数据库，筛选了 16 对多态性 SSR 引物，为薄壳山核桃品种分子鉴别提供了重要的遗传标记，同时也为开展植物品种分子鉴别的方法提供了重要参考。

薄壳山核桃(Carya illinoinensis)；基因组；微卫星；引物多态性