研究报告/Research Report

花生籽仁高通量转录组文库构建与检测  

殷冬梅 , 王允 , 张幸果 , 李贺敏 , 崔党群
河南农业大学, 郑州, 450002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 25 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.000431
收稿日期: 2014年08月25日    接受日期: 2014年10月01日    发表日期: 2014年10月31日
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摘要

高质量转录组文库的构建为高通量测序和基因克隆等奠定基础。本研究以花生高、低含油量品种为研究对象,成功构建了花生籽仁早期和中后期4个转录组测序文库,利用Solexa高通量测序平台,共获得53 924 092条Clean reads,总测序长度达4 853 168 280 nt,组装后获得59 236条Unigenes序列,总长度为44 505 000 nt,平均长度为751 nt,N50值高达1 130,大于等于2 000 nt的Unigenes有3 643条,占总Unigenes的6.15%。研究结果表明组装质量较高,为花生种子特定发育时期的表达谱分析、为花生高、低含油量品种油脂合成差异基因的筛选奠定了良好的基础。

关键词
花生;籽仁;转录组文库

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《分子植物育种》印刷版
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