研究报告

芸薹属物种(B. napus, B. rapa, B. oleracea) PHB基因的生物信息学分析  

王晗* , 闫敏 , 许晔 , 王仁雷 , 刘少华
江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院, 江苏省生物功能分子重点建设实验室, 南京, 211200
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2021年01月16日    接受日期: 2021年01月20日    发表日期: 2021年07月26日
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摘要

HD-ZIP 基因家族参与植物胚胎发生、分生组织形成、叶极性建立和维管组织分化等过程。本研究利用生物信息学方法,对 HD-ZIP 成员之一 PHABULOSA (PHB)进行鉴定,在甘蓝型油菜、白菜和甘蓝中共获得 7 PHB 成员,并对其核苷酸和氨基酸序列的基本特征、结构域、保守基序、基因结构和系统进化关系进行了分析。结果表明,这些 PHB 蛋白编码不稳定的亲水性蛋白,所有成员均含有 HomeoboxbZIPSTART MEKHLA 保守结构域,PHB 位点在三个物种间的进化符合禹氏三角理论。序列分析及测序结果显示白菜的两个 PHB 基因在 miR165miR166 结合位点处存在一个碱基差异。本研究为进一步揭示芸薹属物种 PHB 基因功能提供了依据。
 

关键词
芸薹属;PHB;miR165;miR166;生物信息学

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