梅启明^1,2 , 董斌^3* , 王丹¹ , 郑明轩⁴

1西华师范大学生命科学学院,南充, 637009; 2中国科学院华南植物园,广州, 510650; 3广东农工商职业技术学院,广州, 510507; 4华南农业大学林学与风景园林学院,广州, 510642
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2020年12月06日    接受日期: 2020年12月11日    发表日期: 2021年06月02日

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车前属（Plantago）植物车前（P. asiatica）和大车前（P. major）是中国传统药用植物。本研究采用流式细胞术与K-mer分析方法对车前和大车前的基因组大小进行测定，为后续全基因组测序提供参考。实验过程采用WPB缓冲液解离并制备车前和大车前嫩叶材料的细胞核悬浮液，以玉米基因组DNA为对照，通过流式细胞仪测定经碘化丙啶（PI）染色的车前属植物细胞核样品的荧光强度,计算基因组大小。此外，本研究还采用高通量测序技术对车前和大车前进行双末端测序,同时利用K-mer法估计基因组大小，并分析杂合率、重复序列和GC含量等信息。结果显示，利用流式细胞术测得车前基因组大小约为2386.01 Mb；大车前基因组大小约为743.14 Mb。而通过基因组测序，分别获得了78 Gb的车前和58 Gb的大车前基因组数据。K-mer分析的结果表明，车前基因组大小约为2161.54 Mb，测序深度为36 X；大车前基因组大小约为701.17 Gb，测序深度为80 X，K-mer分布曲线图显示车前和大车前都是低杂合基因组，车前基因组含有较高比例的重复序列。研究结果为揭示车前属植物基因组大小的进化提供了重要证据，也为后续三代全基因高通量测序和组装提供了必要的数据参考。

车前；大车前；流式细胞； K-mer分析；基因组大小