研究报告

露地菊(Chrysanthemum×grandiflora) CgbHLH113 基因的克隆和生物信息学表达分析  

岳莉然1 , 尹航1 , 刘颖婕1 , 周蕴薇2*
1 东北林业大学园林学院, 哈尔滨, 150000; 2 吉林农业大学园艺学院, 长春, 130118
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2020年12月04日    接受日期: 2020年12月14日    发表日期: 2023年04月17日
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摘要

bHLH 转录因子在植物抵御外界环境胁迫过程中发挥着重要的作用。首先,bHLH 转录因子通过调节胁迫相关抗性基因的表达,从而增强植物对于逆境环境的耐受性。为探究在非生物胁迫下露地菊 bHLH转录因子的相关功能,本实验以前期已经获得的露地菊转录组数据为前提,筛选出表达差异显著且具有完整开放阅读框的 bHLH 转录因子,利用 PCR 技术对目的基因 ORF 区进行克隆,实验结果表明,CgbHLH113 基因全长 450 bp,总共编码 149 个氨基酸残基。利用在线软件对目的基因进行生物信息学分析,结果显示该目的蛋白的相对分子质量为 16.429 8 kD,理论等电点为 8.63,不稳定系数为 59.07,亚细胞定位预测 CgbHLH113是位于细胞核内的亲水性蛋白,没有跨膜结构,无信号肽。蛋白质二级结构中 α- 螺旋占 37.58%,延伸链9.40%,β- 转角 5.37%,无规则卷曲 47.65%。利用 RT-qPCR 技术对目的基因进行表达模式分析,结果表明盐胁迫、干旱胁迫均能诱导 CgbHLH113 基因的表达。本实验为探究露地菊 bHLH 转录因子在非生物胁迫下的调节机制提供了基础。

关键词
露地菊(Chrysanthemum×grandiflora);基因克隆;bHLH 转录因子;非生物胁迫

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《分子植物育种》印刷版
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