张引弟^1,2 , 陈爱娥³ , 白继鹏^1,2 , 王波^1,2 , 李灿辉^1,2* , 王洪洋^1,2*

1 云南师范大学, 云南省马铃薯生物学重点实验室, 昆明, 650500; 2 云南师范大学, 云南省高校马铃薯生物学重点实验室, 昆明, 650500; 3 云南师范大学教务处, 昆明, 650500
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2020年12月03日    接受日期: 2020年12月09日    发表日期: 2021年08月16日

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空心是马铃薯块茎内部生理缺陷性状，它会严重影响马铃薯的鲜食和加工。为了解马铃薯空心块茎不同形成时期的差异表达基因和探究与空心块茎形成密切相关功能基因。本研究采用 RNA-Seq 技术对马铃薯空心敏感性材料('5-19')块茎无空心期(N)、空心轻微期(S, 空心长度 0~1 cm)、空心较重期(M, 空心长度1~3 cm)进行转录组分析。结果显示，各送样样品高质量碱基均达到 6.54 Gb，各组样品 Q30 碱基百分比均在94.15%以上。N-vs-S 和 S-vs-M 的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)数目分别为 44 和 130个。GO 功能注释显示差异表达基因主要集中在代谢过程、细胞过程、单组织过程、结合、催化活性、细胞组分等。KEGG 代谢通路富集发现，差异表达基因显著富集到角质素、木栓质、蜡状物合成、苯丙烷生物合成、脂肪酸延长、苯丙氨酸代谢等途径。进一步分析挖掘到 19 个与马铃薯块茎空心形成相关基因。本研究解析了马铃薯空心块茎形成过程中的转录调控分子机制，为后续研究提供了相关基因数据信息。
 

马铃薯；空心；转录组； 差异表达基因