研究报告

菜心 Dof 基因克隆、生物信息学分析及表达分析  

朱云娜 , 蔡墩旭 , 郑开聪 , 邓浩坤 , 卢大兴 , 刘建国*
韶关学院英东生物与农业学院, 韶关, 512005
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2020年11月11日    接受日期: 2020年11月27日    发表日期: 2023年02月21日
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摘要

Dof (DNA binding with one finger)是植物特有的转录因子,在调控植物生长发育和代谢过程中发挥着重要作用。为明确 Dof 具体的生物学功能,本研究以‘油绿 501’菜心为材料,采用同源克隆法获得了 Dof全长序列,并对其编码蛋白结构、基因表达模式及其互作蛋白的调控网络进行分析。结果表明:菜心 BcDof3;1基因全长 624 bp,编码 207 个氨基酸,其 N- 端含有保守的 Dof 锌指结构。系统进化树分析表明,BcDof3;1 与白菜 BrDof3;1 和拟南芥 AtDof2 的同源关系较近。RT-qPCR 结果表明,BcDof3;1 在菜心根、茎、叶、花和种子中均有表达,尤其在叶和花中的表达水平最高;其表达水平受氮调控。互作蛋白网络分析表明,BcDof3;1 可能通过中性转化酶、淀粉酶、酰胺酶等调控碳氮代谢。研究结果为深入研究 Dof 在菜心生长发育和碳氮代谢中提供了理论参考。

关键词
菜心;Dof 转录因子;基因克隆;生物信息学分析;基因表达

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《分子植物育种》印刷版
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