研究报告

参薯 miR156 和靶基因 SPL 特征分析  

刘梦丽1 , 冯雅兰2 , 王丹丹2 , 夏薇2*
1 海南大学生命科学与药学院, 海口, 570228; 2 海南大学热带作物学院, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2020年11月02日    接受日期: 2020年11月06日    发表日期: 2021年09月25日
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摘要

参薯(Dioscorea alata)在热带和亚热带广泛种植,为该地区的人提供了粮食,具有重要的经济价值。miR156 及其靶基因 SPL 对植物的生长发育的调控起到重要的作用,为了分析参薯中 miR156-SPL 的调控模块,本研究对参薯 miR156 基因位点和对应靶基因进行预测和验证。基于参薯基因组以及转录组信息,一共得到 DamiR156 8 个基因位点,预测了 miR156 6 个靶基因,其中 4 个属于 SPL 基因家族。多序列比对分析发现 8 Da-miR156 的前体序列在发卡区高度保守,根据序列同源性可以分为 3 组。表达谱数据和 RT-qPCR 表明 DamiR156 在参薯组培再生植株的叶、茎、块茎各个组织表达量远高于田间参薯,且在块茎中表达量也高于其他组织,初步推断 Da-miR156 在薯块发育的过程中发挥作用。5'-RLM-RACE 实验验证了 DaSPL miR156 切割的位点,为开展参薯 SPL 基因功能分析提供了参考依据。本研究通过对参薯 miR156 和靶基因 SPL 特征研究为分析 miR156-SPL 调控模块在参薯薯块发育中的作用打下科学基础。

关键词
参薯(Dioscorea alata);miR156;SPL;靶基因

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《分子植物育种》印刷版
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