研究报告

筇竹钾转运体 QtHAK12 的克隆及表达分析  

赵小艳 , 李倩 , 王澍*
西南林业大学园林园艺学院, 国家林业与草原局西南风景园林工程技术研究中心, 昆明, 650224
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2020年10月19日    接受日期: 2020年10月26日    发表日期: 2022年09月13日
© 2022 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

钾元素在竹笋中含量较高,也是竹笋品质的重要指标之一。为了研究高亲和性 K+转运蛋白 KUP/HAK/KT 家族成员在竹笋 K+吸收过程中发挥的重要作用。本研究利用 RACE 技术从筇竹(Qiongzhuea tumidinoda)中克隆得到一个 KUP/HAK/KT 家族成员的同源基因,命名为 QtHAK12 (登录号: MT078986)。同时,对 QtHAK12 基因进行生物信息学及表达模式分析。结果表明,QtHAK12 基因片段全长为 2 467 bp,编码区为 1 647 bp,包含 548 个氨基酸。生物信息学分析表明,该编码蛋白具有 10 个跨膜区域,定位于细胞质膜上,并且具有 KUP/HAK/KT 钾转运体的典型结构“K-trans”结构域。聚类结果表明,QtHAK12 编码蛋白与狗尾巴草(Setaria viridis)、小米(Setaria italica)、水稻(Oryza sativa)等作物 HAK 蛋白相似度高达 89%以上,同源性分别为 90.17%90.17%89.89%RT-qPCR 结果显示,QtHAK12 基因在不同组织(, , , )中均有表达,且为非诱导表达。低钾和高盐处理下,筇竹不同组织表达量呈现出根叶的规律。与对照组相比,在50 mmol/L KCl 处理下,根部处理 12 h QtHAK12 基因表达上调,而其他组织处理 1224 h 后,QtHAK12 基因表达均下调。另外,与对照组相比,在 500 mmol/L NaCl 处理下,不同组织处理不同时间后,QtHAK12 基因的表达均呈下调趋势。

关键词
筇竹(Qiongzhuea tumidinoda);QtHAK12;RACE 克隆;生物信息学分析;表达分析

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
赵小艳
.
李倩
.
王澍*
相关论文
.
筇竹(Qiongzhuea tumidinoda)
.
QtHAK12
.
RACE 克隆
.
生物信息学分析
.
表达分析
服务
. 发表评论