研究报告
甘蓝型油菜 BnaSVB 基因的克隆及 DUF538 基因家族的鉴定 
燕佳琦 
,
李萍 ,
张鹤 ,
张燕 ,
秦梦凡 ,
王凯 ,
张琪 ,
徐爱遐 ,
黄镇 
,
李萍 ,
张鹤 ,
张燕 ,
秦梦凡 ,
王凯 ,
张琪 ,
徐爱遐 ,
黄镇
西北农林科技大学农学院, 杨凌, 712100
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 1 篇
收稿日期: 2020年10月14日 接受日期: 2020年11月01日 发表日期: 2022年04月28日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 1 篇
收稿日期: 2020年10月14日 接受日期: 2020年11月01日 发表日期: 2022年04月28日
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摘要
为了研究甘蓝型油菜(Brassica napus L.)中 SVB 基因的功能以及甘蓝型油菜 DUF538 基因家族的特性，本研究在甘蓝型油菜耐盐品系 862 中克隆了 BnaSVB 基因的 CDS 序列，并首次在甘蓝型油菜全基因组中鉴定出 DUF538 基因家族。生物信息学分析结果显示，BnaSVB 基因 CDS 序列长 468 bp，编码 155 个氨基酸，含有一个未知功能的 DUF538 结构域；BnaSVB 基因和 SVB 基因编码蛋白理化性质相似，均属于亲水性蛋白，磷酸化位点较高，无跨膜区域；它们的一级、二级结构相似，三级结构存在显著差异，又存在 10 处氨基酸的差异位点，其中还包含两处氨基酸位点的缺失，这可能会造成它们基因功能的不同。本研究利用 Hm-mer 3.1 和 blastp 首次在甘蓝型油菜全基因组中鉴定并筛选出了 78 个 DUF538 基因家族成员，将其分为三个亚族，并对其家族成员基因结构、蛋白理化性质、染色体定位、motif、系统进化做了初步分析，以期为该基因的进一步研究打下基础。
关键词
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)；BnaSVB 基因；DUF538 结构域；基因家族；生物信息学分析
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