周文才 , 李进 , 左继林 , 唐山

江西省林业科学院, 江西省油茶种质资源保护与利用重点实验室, 南昌, 330013
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2020年10月10日    接受日期: 2020年10月25日    发表日期: 2022年04月28日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

光皮树是重要的木本油料树种，也是优良的用材、园林绿化及生态树种，其分子生物学研究进展缓慢。本研究采用 Illumina 高通量测序技术及 K-mer 分析等生物信息学方法，首次开展了光皮树全基因组调查，结果表明：(1)光皮树基因组大小为 1 001.81 Mb；(2)光皮树基因组杂合率为 0.77%，重复序列比例为 62.84%，GC 含量为 35.82%；(3)利用 SOAP de novo 软件对 50.10 Gb 序列进行组装，得到 1 313 158 条 scaffold，拼接序列总长为 897 216 182 bp，scaffold N50 为 2 842 bp。根据光皮树基因组各指标的评估，推测光皮树基因组具有较高的重复序列和杂合率，本研究结果为光皮树进一步全基因组测序策略等提供了理论依据。

光皮树；基因组调查；基因组大小；杂合率；GC 含量