刘艳晶^1,2,3 , 孙贵连³ , 周琴³ , 邹雪梅³ , 黄小龙^1,2,3*

1 贵州师范大学, 贵州省植物生理与发育调控重点实验室, 贵阳, 550025; 2 贵州师范大学, 西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室, 贵阳, 550025; 3 贵州师范大学生命科学学院, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2020年10月09日    接受日期: 2020年10月16日    发表日期: 2022年09月07日

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LysM 结构域包含蛋白(LysM domain containing protein)是一类重要的病原菌信号受体蛋白。为了更好地了解森林草莓 FvLysM 基因家族的成员及其特征，本研究以先获得拟南芥 LysM 的保守序列作为参考，通过 TBtools 软件比对得到森林草莓 FvLysM 基因家族成员并进行命名；数据库分析家族成员的染色体定位、基因结构；分析得到 FvLysM 蛋白的理化性质、亚细胞定位；比较 FvLysM 基因在发育阶段不同时期不同组织的表达量并利用 R 软件对其表达模式进行可视化；通过植物顺式调控数据库分析 FvLysM 基因启动子元件。通过鉴定共获得 15 个森林草莓 FvLysM 基因，其不均匀地分布在 4 条染色体上，基因结构和功能结构域较为保守；编码 268~682 个氨基酸，其分子量介于 29 311.84~74 828.69 kD 之间，等电点介于 5.11~9.26；绝大多数位于细胞膜上；进化上与苹果的亲缘关系最近。森林草莓 FvLysM 基因具有组织特异性表达特点：FvLysM5 和 FvLysM12 在整个植株发育时期表达量较高，FvLysM5 和 FvLysM8 可能参与有性生殖；通过启动子分析表明其具有较多与免疫反应和花粉发育相关的顺式作用元件。本研究从全基因组水平确定森林草莓FvLysM 基因家族成员并通过数据库分析 FvLysM 基因家族成员的染色体位置、基因结构、理化性质、进化特征、表达谱以及启动子元件，为进一步研究 FvLysM 基因在森林草莓病害中的作用及参与生长发育提供了理论依据。

森林草莓；LysM 基因家族；表达分析；抗病性；调控