研究报告

基于转录组数据挖掘桑树bHLH转录因子家族  

李季生 , 李娜 , 贾漫丽 , 王彬彬 , 范伟 , 夏爱华
承德医学院蚕业研究所, 河北省高校特产蚕桑应用技术研发中心, 承德, 067000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2020年10月02日    接受日期: 2020年10月17日    发表日期: 2022年03月28日
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摘要

bHLH转录因子在植物生长发育调节、生物/非生物胁迫应答以及次生代谢过程中发挥着重要的调控作用,但有关桑树bHLH转录因子的报道还相对较少,不利于开展相关方面的探索。本研究借助生物信息学技术鉴定到54个桑树bHLH转录因子,并对其保守序列、基因结构、蛋白进化和组织表达进行了分析。结果表明,桑树bHLH转录因子含有2个保守功能域,位于N端的碱性区域和C端的HLH区域。N端的碱性区域由12个氨基酸残基组成,其中第9位和第10位上的精氨酸具有较强的保守性;C端的HLH区域由45个氨基酸组成,第2050位上的亮氨酸高度保守,可能与二聚体的形成有关。在基因结构方面,大部分转录因子均含有内含子结构,相位类型有23种,以00-0型为主,各有10个基因。从蛋白家族系统进化上看,桑树bHLH蛋白与同源性较近的拟南芥序列交错排布,被划分在4个大的进化组中。多数基因在桑树的根、皮、冬芽、雄花和叶片中均有表达,5个基因具有明显的组织特异性,但表达量较低。本研究为进一步开展桑树bHLH转录因子的功能研究提供了理论依据。

关键词
桑树;bHLH 转录因子;生物信息学分析; 组织表达;转录组

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《分子植物育种》印刷版
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