西瓜 NCED 基因的鉴定及其对枯萎病和脱落酸的表达模式分析  

依秀
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 0 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘要
脱落酸(abscisic acid, ABA)是植物生长发育和逆境胁迫所必需的一种重要的植物激素,而 9- 顺式- 环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)是催化植物 ABA 合成的关键限速酶,在植物对干旱、高盐及病原菌等逆境的响应过程中发挥十分重要的作用。然而,目前还没有报道对西瓜中的 ClNCED 基因进行分离和鉴定。本研究在西瓜基因组中利用生物信息学技术共鉴定出 10 条


ClNCED 基因,预测并分析了这 10 条ClNCED 基因的基因结构、染色体位置、亚细胞定位等基本信息及在西瓜不同组织器官、ABA 和枯萎病处理下的表达模式。亚细胞定位预测发现大部分西瓜 ClNCED 蛋白主要被定位在叶绿体和细胞质中。利用不同物种的 NCED 蛋白进行进化分析发现西瓜 ClNCED 蛋白聚类在 5 个亚族中。亚族郁是西瓜特异亚族,只包含一对串联重复基因 ClNCED09ClNCED10 编码的蛋白。在所有西瓜 ClNCED 基因中,只有一半有内含子,内含子数由 5~12 不等。另外,我们还利用荧光定量 PCR (RT-qPCR)对 ClNCED 基因的时空表达模式进行分析,发现一半的西瓜 ClNCED 基因为特异表达基因,并且大部分在雄花中优势表达。此外,我们从ClNCED 基因的启动子中发现了许多重要的顺式作用元件,这些元件与激素和逆境相关,对西瓜 ClNCED基因在喷施 ABA 及接种尖孢镰刀杆菌后的表达水平进行分析,发现绝大部分 ClNCED 基因能响应 ABA 处理,同时还鉴定到多个响应枯萎病的 ClNCED 基因,这也为今后西瓜 ClNCED 基因的功能鉴定及相关的抗病分子育种提供重要的理论依据。
关键词

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