肖昉 , 陈何 , 陈家兰 , 赵春丽 , 郑友峰 , 刘生财^*

福建农林大学, 园艺植物生物工程研究所, 福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2020年09月21日    接受日期: 2020年09月30日    发表日期: 2022年09月07日

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ADH 基因在甜菜色素生物合成酪氨酸途径中发挥着重要调控作用。为探究苋菜酪氨酸途径关键因子 AtrADH2 密码子的偏好性特征，本研究运用 Codon W、EMBOSS、SPSS 24 和 Origin 2019b 等软件分析了苋菜 AtrADH2 基因的密码子使用特征，与其他 26 个物种 ADH2 基因的密码子使用偏好性和 6 种常见模式生物的密码子使用频率进行比较。结果表明：苋菜 AtrADH2 基因密码子的使用偏好性较弱且偏好使用以 A/T 结尾的密码子，RSCU>1 的有 26 个密码子；所有物种 ADH2 基因的 CDS 序列和 RSCU 值聚类分析在聚类上存在差异，但相似性很高，CDS 序列聚类分析更能准确反映同源关系；不同物种 ADH2 基因密码子各成分均具有极显著相关性；苋菜 AtrADH2 基因的密码子基因位点更接近期望 ENC 曲线，突变压力是偏好性形成的主要因素；大肠杆菌和酵母菌均适合作为苋菜 AtrADH2 基因的异源表达受体，拟南芥是苋菜 AtrADH2 最理想的遗传转化受体。本研究为苋菜 AtrADH2 基因功能的进一步研究提供重要参考。

苋菜；ADH2 基因；密码子偏好性；遗传转化受体