1 河北科技师范学院园艺科技学院, 秦皇岛, 066004; 2 河北科技师范学院, 河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室, 秦皇岛, 066004
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年09月15日 接受日期: 2020年09月25日 发表日期: 2022年08月01日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年09月15日 接受日期: 2020年09月25日 发表日期: 2022年08月01日
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摘要
自封顶类型番茄品种产量与主茎花序数有密切关系,关于控制花序封顶性状基因的研究报道较多,而对控制番茄封顶花序节位的相关研究报道较少。为研究不同自封顶番茄主茎封顶花序节位之间的遗传变异,筛选出参与调控主茎封顶花序节位相关的候选基因。本试验利用重测序技术对 3 个番茄品系 GXF、AXF 和 815 进行变异检测。结果表明,3 个样本共检测到 5 968 501 个 SNP 和 485 114 个 InDel,与参考基因组比对后共发生 33 473 个基因变异,将发生在 CDS 区的变异基因进行 GO 和 KEGG 数据库比对,发现主要集中于基础代谢和玉米素的生物合成。通过基因组序列比对分析,筛选获得 16 个可能是参与调控番茄主茎封顶花序节位的关键基因。研究结果明确了相关基因的变异位点信息,为进一步研究自封顶番茄花序节位的遗传机理奠定了基础。
关键词
番茄;自封顶;花序节位;重测序;变异检测
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