研究报告

基于重测序的 3 个自封顶番茄品系基因组变异检测分析  

杜海东1 , 游茜1 , 李毅丰1 , 王帅1,2* , 毛秀杰1,2 , 张宁1,2
1 河北科技师范学院园艺科技学院, 秦皇岛, 066004; 2 河北科技师范学院, 河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室, 秦皇岛, 066004
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2020年09月15日    接受日期: 2020年09月25日    发表日期: 2022年08月01日
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摘要

自封顶类型番茄品种产量与主茎花序数有密切关系,关于控制花序封顶性状基因的研究报道较多,而对控制番茄封顶花序节位的相关研究报道较少。为研究不同自封顶番茄主茎封顶花序节位之间的遗传变异,筛选出参与调控主茎封顶花序节位相关的候选基因。本试验利用重测序技术对 3 个番茄品系 GXFAXF 815 进行变异检测。结果表明,3 个样本共检测到 5 968 501 SNP 485 114 InDel,与参考基因组比对后共发生 33 473 个基因变异,将发生在 CDS 区的变异基因进行 GO KEGG 数据库比对,发现主要集中于基础代谢和玉米素的生物合成。通过基因组序列比对分析,筛选获得 16 个可能是参与调控番茄主茎封顶花序节位的关键基因。研究结果明确了相关基因的变异位点信息,为进一步研究自封顶番茄花序节位的遗传机理奠定了基础。

关键词
番茄;自封顶;花序节位;重测序;变异检测

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《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
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