大连民族大学环境与资源学院, 大连, 116600
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年09月15日 接受日期: 2020年09月30日 发表日期: 2022年09月14日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年09月15日 接受日期: 2020年09月30日 发表日期: 2022年09月14日
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摘要
苹果酸酶(ME)参与苹果酸的降解,是植物苹果酸代谢的关键酶。本研究根据前期的沙棘转录组测序数据设计特异性引物,利用 RT-PCR 技术克隆 ME 基因(NAD-ME, NADP-ME)并进行生物信息学分析。结果表明,沙棘 NAD-ME 基因的完整开放阅读框长 1 902 bp,编码一个由 634 个氨基酸组成的亲水性蛋白,主要由α- 螺旋(44.16%)、无规则卷曲(39.91%)和少量 β- 折叠(15.93%)构成,与枣的 NAD-ME 同源性最高。NADP-ME的完整开放阅读框长1 926 bp,编码一个由642 个氨基酸组成的亲水性蛋白,主要由α- 螺旋(37.07%)、无规则卷曲(45.64%)和少量 茁- 折叠(15.29%)构成,与川桑和核桃 NADP-ME 的同源性较高。研究结果为探索沙棘苹果酸代谢的分子调控机制奠定理论基础。
关键词
沙棘;苹果酸酶;克隆;生物信息学分析
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