凯里学院大健康学院,凯里, 556000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 11 篇
收稿日期: 2020年09月07日 接受日期: 2020年09月11日 发表日期: 2021年03月16日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 11 篇
收稿日期: 2020年09月07日 接受日期: 2020年09月11日 发表日期: 2021年03月16日
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摘要
采用 Illumina测序技术对在醋酸钙、硫酸铵和蔗糖处理后蓝莓不同发育阶段的果实进行转录组测序,获得 Clean Reads 2 723 731 442条,经组装得到平均长度为 753.65 nt的 87 608条 Unigene。将转录组Unigene进行基因功能注释,其中 39 867条 Unigene能被 NR数据库注释,与葡萄同源序列最多,占 8.58%;与 GO数据库比对发现,有 29 661条 Unigene获得注释,分别匹配到生物过程、细胞组成和分子功能三大类共 59个分支;与 KOG数据库进行比对,发现有 21 992条 Unigene具有功能信息,分别涉及 25类;根据 KEGG数据库的注释信息进行 Pathway注释,参与的代谢通路共有 246条;共检测到 8 704个 SSR位点,其中双碱基重复的 SSR占 78.57%。本研究为探索外源物质调控蓝莓果实生长发育、生理代谢的分子机理提供了理论基础。
关键词
外源因子;蓝莓果实;不同发育阶段;转录组;基因功能注释
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