研究报告

外源因子处理下蓝莓不同发育阶段果实的转录组分析  

彭舒 , 袁玮 , 张婷渟 , 杨芩*
凯里学院大健康学院,凯里, 556000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2020年09月07日    接受日期: 2020年09月11日    发表日期: 2021年03月16日
© 2021 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

采用 Illumina测序技术对在醋酸钙、硫酸铵和蔗糖处理后蓝莓不同发育阶段的果实进行转录组测序,获得 Clean Reads 2 723 731 442条,经组装得到平均长度为 753.65 nt87 608Unigene。将转录组Unigene进行基因功能注释,其中 39 867Unigene能被 NR数据库注释,与葡萄同源序列最多,占 8.58%;与 GO数据库比对发现,有 29 661Unigene获得注释,分别匹配到生物过程、细胞组成和分子功能三大类共 59个分支;与 KOG数据库进行比对,发现有 21 992Unigene具有功能信息,分别涉及 25类;根据 KEGG数据库的注释信息进行 Pathway注释,参与的代谢通路共有 246条;共检测到 8 704SSR位点,其中双碱基重复的 SSR78.57%。本研究为探索外源物质调控蓝莓果实生长发育、生理代谢的分子机理提供了理论基础。

关键词
外源因子;蓝莓果实;不同发育阶段;转录组;基因功能注释

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 19 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
彭舒
.
袁玮
.
张婷渟
.
杨芩*
相关论文
.
外源因子
.
蓝莓果实
.
不同发育阶段
.
转录组
.
基因功能注释
服务
. 发表评论