研究报告

马铃薯 CDPK 基因的克隆及生物信息学分析  

田再民1 , 赵益1,2 , 纪艺红3 , 冯琰3 , 龚学臣1 , 刘毅强1 , 翟鑫娜1 , 张云帅1 , 王燕1 , 魏东1,4
1 河北北方学院农林科技学院, 张家口, 075000; 2 河北农业大学植物保护学院, 保定, 071000; 3 河北北方学院, 旱作农业研究中心, 张家口, 075000; 4 河北北方学院, 河北省农产品食品质量安全分析检测重点实验室, 张家口, 075000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2020年08月17日    接受日期: 2020年09月01日    发表日期: 2022年09月14日
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摘要
 

钙依赖蛋白激酶基因(CDPK)在环境胁迫中对植物具有非常重要的调节作用。为了研究 StCDPK 基因在马铃薯生长发育过程中的作用和功能,本试验以马铃薯组培苗‘夏坡蒂’为材料,从马铃薯 cDNA 中克隆得到 CDPK 基因,并进行生物信息学分析;通过 RT-qPCR 方法,在干旱、低温和高温胁迫下对 StCDPK 基因的表达量进行初步分析。结果表明,克隆出的 StCDPK 基因全长 1 620 bp,开放阅读框全长 1 599 bp,编码532 个氨基酸;蛋白质相对分子质量 58 979.29,理论等电点(pI)为 6.49;平均亲水系数 -0.402,为亲水性蛋白;α- 螺旋占 42.48%,无规曲线区域占 37.03%;并通过同源蛋白比对,与龙葵同源性最高;通过构建基因进化树,发现与大豆在同一分支上;RT-qPCR 分析表明,干旱、低温、高温均能诱导StCDPK 基因的表达,结果表明StCDPK 基因可能在非生物胁迫中起着重要作用。

关键词
马铃薯; CDPK;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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