研究报告

马铃薯 StWRKY40 基因的序列及表达模式分析  

杨振红1 , 王芳1,2,3,4,5 , 王舰1,2,3,4,5*
1 青海大学, 西宁, 810016; 2 青海省农林科学院, 西宁, 810016; 3 青海大学, 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室, 西宁, 810016;4 青海大学, 青藏高原生物技术教育部重点实验室, 西宁, 810016; 5 青海省农林科学院, 青海省马铃薯育种重点实验室, 西宁, 810016
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2020年08月09日    接受日期: 2020年08月11日    发表日期: 2020年12月09日
© 2020 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘要

WRKY转录因子是植物重要的调节因子,在植物逆境生长过程中起着关键的作用。本研究以青薯9为试验材料,基于RT-PCR技术获取StWRKY40基因序列,利用DNAMANMEGA 7.0ExPASy-ProtParam tool等软件对其进行生物信息学分析,通过QRT-PCR技术分析干旱胁迫(10% PEG-8000)和盐胁迫(NaCl浓度为150 mmol·L-1)下该基因的表达模式,以探究StWRKY40在非生物胁迫下的调控作用。生物信息学分析结果表明:StWRKY40的全长序列为1713 bpCDS序列为1083 bp。该基因编码蛋白全长为360 a,相对分子质量为39.79 Ku,脂溶指数为64.72,理论等电点为8.37。其平均亲水系数为-0.698,说明StWRKY40基因编码的蛋白表现为亲水性。StWRKY40与番茄WRKY40的亲缘关系最近,相似性高达94.16%StWRKY40启动子除含有常见的CAAT-box顺式元件,还含有胁迫应答元件(TC-rich repeats)和干旱胁迫响应元件(DRE core)。QRT-PCR结果表明:盐胁迫4 d时,茎中的表达量最高,为对照的19.54倍;干旱胁迫8 d时,叶中的表达量最高,为对照的5.7倍。利用 Gateway 技术成功构建 pJAM1502-StWRKY40 表达载体。本研究为深入研究马铃薯WRKY 基因的功能提供了理论基础,同时在提高马铃薯抗逆性能力和分子育种方面提供了一定的参考依据。 

关键词
马铃薯(Solanum tuberosum L.);WRKY 转录因子; 序列分析;逆境胁迫;表达模式分析

HTML格式版本正在制作中。
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
杨振红1
.
王芳1,2,3,4,5
.
王舰1,2,3,4,5*
相关论文
.
马铃薯(Solanum tuberosum L.)
.
WRKY 转录因子
.
序列分析
.
逆境胁迫
.
表达模式分析
服务
. 发表评论