评述与展望/Reviews and Progress

SNP检测方法的研究进展  

许家磊1 , 王宇2 , 后猛1,3 , 李强1,2,3
1 中国农业科学院甘薯研究所, 甘薯遗传改良重点开放实验室, 农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室, 徐州, 221131;
2 江苏师范大学, 徐州, 221116;
3 江苏徐淮地区徐州农业科学研究所, 江苏徐州甘薯研究中心, 徐州, 221131
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 31 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.000475
收稿日期: 2014年05月26日    接受日期: 2014年07月10日    发表日期: 2014年09月23日
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摘要

作为近年来最有发展潜力的第三代分子标记,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)在遗传分析中得到了广泛应用。目前SNP的检测方法大致可以分为两大类:一大类是以单链构象多态性(SSCP)、变性梯度凝胶电泳(DDGE)、酶切扩增多态性序列(CAPS)、等位基因特异性PCR (allele-specific PCR, AS-PCR)等为代表的以凝胶电泳为基础的传统经典的检测方法。另一大类是以直接测序、DNA芯片、变性高效液相色谱(DHPLC)、质谱检测技术、高分辨率溶解曲线(HRM)等为代表的高通量、自动化程度较高的检测方法。本文综述了两大类SNP检测方法中主要检测技术的原理和应用,并分析在实际应用中各种检测技术的优缺点。

关键词
SNP;基于凝胶电泳的检测方法;高通量自动化检测方法

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《分子植物育种》印刷版
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