高美萍^1,2 , 黄诚梅¹ , 林志城¹ , 江文¹ , 蒋慧萍¹

1 广西壮族自治区农业科学院生物技术研究所, 南宁, 530007; 2 福建农林大学园艺学院, 福州, 350000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2020年07月28日    接受日期: 2020年08月11日    发表日期: 2023年01月30日

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为了研究慈姑球茎发育过程中转录组功能基因表达情况，本研究对其不同时期进行转录组测序，获得表达基因信息，以探讨球茎发育相关基因的表达特征及淀粉合成代谢相关调控。结果显示，慈姑球茎测序组装后共获得 63.53 Gb 的Clean Reads，总共获得 60 884 个 Unigene，平均长度为 897.34 bp，N50 为 1.368 kb。使用五个公共数据库成功注释了总共 36 590 个Unigene。组装完整性较高，效果好。差异表达基因分析表明，慈姑匍匐茎膨大为球茎初期，差异基因最多，表现最为活跃。GO (Gene ontology)功能富集中，21 453 个基因获得功能注释，分为分子功能、细胞组分和生物学过程 3大类和 54 个亚类。COG (Clusters of orthologousgroups)功能分类中，13 653 个基因分布于 25 个功能区域，其中碳水化合物代谢占重要地位。KEGG (Kyotoencyclopedia of genes and genomes)代谢通路注释中，14 226 个基因获得功能注释，共有 118 条代谢途径，其中淀粉 - 蔗糖代谢占主要作用。本研究首次建立了丰富的慈姑球茎的转录组数据库，对进一步深化解析慈姑球茎淀粉生物合成的分子机制提供数据基础。

慈姑；球茎；转录组；不同发育时期