研究报告

苗药八爪金龙基原植物DNA条型码的筛选与鉴定  

潘婕1 , 刘畅1 , 俸婷婷1,2 , 刘雄伟1 , 周永强1 , 石慧1 , 周英1,2*
1贵州中医药大学药学院,药食两用资源应用与开发研究中心,中药材开发技术研究中心,贵阳, 550025; 2贵州大学,贵州省药食同源植物资源开发工程技术研究中心,贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2020年07月04日    接受日期: 2020年07月08日    发表日期: 2021年01月21日
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摘要

八爪金龙属紫金牛科(Myrsinaceae)紫金牛属(Ardisia)植物,是常用民族药,其抗病毒、抗心律失常、抗肿瘤的效果显著。八爪金龙的基原植物表型极度相似,导致其应用混乱。本研究筛选适用于八爪金龙基原植物鉴定的 DNA条形码序列,以探索高效准确鉴定八爪金龙基原植物的新方法。提取了百两金、朱砂根和红凉伞的植物基因组 DNA,利用 DNA条形码序列(ITS,ITS2,RbcL,PsbA-trnH)对其进行 PCR扩增和测序,比较各序列的扩增率和测序率,应用 BLAST方法来评估各序列的鉴定效率。同时与 9种紫金牛属植物的相应序列进行比对,构建 NJ树。结果表明:ITSITS2RbcL 序列的扩增成功率和测序成功率均为 100%PsbA-trnH 序列的扩增成功率和测序成功率分别为 97.7%96.7%4个候选序列的 BLAST成功率结果:ITS=ITS2 (100%)>PsbA-trnH (99.2%)>RbcL (33.3%)ITS 序列的平均种间遗传距离大于平均种内遗传距离。系统发育树构建结果显示,ITS2 序列的 NJ树可将百两金、朱砂根和红凉伞单聚成一支,与同属植物区别开;PsbA-trnH 片段将朱砂根、红凉伞单聚为一支,区别于其他同属植物;ITS 序列能将不同基原聚成不同的分支,区别于同属植物,但朱砂根和红凉伞需进一步研究。各结果显示ITS 序列较其他序列有明显优势,本研究建立了基于ITS 序列的八爪金龙基原的 DNA条形码鉴定技术方法,为临床准确用药提供依据。
 

关键词
八爪金龙(Raxid Ardisia);近缘植物;DNA条形码;ITS 序列

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《分子植物育种》印刷版
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