研究报告

软枣猕猴桃LDOX 基因结构特征分析及蛋白互作网络构建  

刘振盼 , 卢立媛 , 孙阳 , 张悦 , 李冬生 , 尤文忠*
辽宁省经济林研究所,大连, 116031
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2020年07月03日    接受日期: 2020年07月10日    发表日期: 2021年12月11日
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摘要

本研究为揭示软枣猕猴桃中无色花色素双加氧酶(leucoanthocyanidin dioxygenase,LDOX)基因结构及其功能。运用生物信息学方法对软枣猕猴桃LDOX 核苷酸及氨基酸序列进行深入分析,构建LDOX 基因的蛋白互作网络,并进行 GOKEGG功能注释分析。结果显示:软枣猕猴桃与野茶树、以南高丛蓝莓、蓝莓、金银花及胡萝卜亲缘关系较近,含有 10个保守基序。顺式调控元件主要参与 ABA信号途径、响应干旱应答,厌氧诱导、赤霉素、生长素响应因子、MeJA反应、低温响应、光刺激应答响应元件。LDOX理化性质及结构分析表明,其为亲水性蛋白,未发现信号肽及跨膜结构区域,主要包括 Ser磷酸化位点(13)Thr磷酸化位点(12)Tyr磷酸化位点(6)。含有两个 O- 糖基化位点(Thr4Thr323),并且在 107~109残基位置存在 Asn107N- 糖基化位点。48~347 bp处含有 2- 酮戊二酸 -Fe2+- 双加氧酶家族(20G-FeOxy)保守结构域,二级结构主要以无规则卷曲(43.10%)为主。LDOXF3HUFGTFLSPAL等蛋白之间存在一定互作关系,参与类黄酮生物合成及代谢过程,主要在植物型液泡膜中发挥作用,并且具有调控催化活性及氧化还原活性分子功能。LDOX 基因高度保守,在类黄体酮通路中发挥重要的调控作用,为进一步深入探讨软枣猕猴桃LDOX 基因功能机制提供了理论依据。

关键词
软枣猕猴桃;LDOX;结构功能;蛋白互作

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