西北农林科技大学农学院, 杨凌, 712100
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 2 篇
收稿日期: 2020年06月28日 接受日期: 2020年07月06日 发表日期: 2022年02月07日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 2 篇
收稿日期: 2020年06月28日 接受日期: 2020年07月06日 发表日期: 2022年02月07日
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摘要
CCT 基因家族广泛存在于植物中,对植物生长发育有着重要的作用。本研究利用生物信息学方法在小麦全基因组水平一共鉴定到 80 个 CCT 基因,并对其基因结构、进化关系、顺式作用元件、染色体定位和表达模式进行分析。结果表明,80 个小麦 TaCCT 基因在小麦染色体上分布不均,在 A、B、D 染色体组中分别包含有28、24 和 28 个 CCT 基因;根据进化关系将小麦 CCT 基因分为 COL、CMF 和 PRR 3 个亚家族共 13 个亚组;基因结构和保守基序分析发现相同亚组的基因结构和保守结构域基本一致;顺式作用元件分析发现在 TaCCT 基因启动子区一共有 16 种与激素和非生物胁迫响应相关的顺式作用元件;基因复制分析发现一共有 64 个TaCCT 基因组成了 60 个同源基因对,暗示 TaCCT 基因在进化过程中发生了基因的复制和扩张;表达模式分析表明,TaCCT 基因在不同组织和胁迫条件下存在差异表达,说明 TaCCT 基因广泛参与小麦生长发育和响应非生物胁迫中发挥重要作用。本研究为进一步研究小麦 CCT 家族基因机制以及小麦品质改良提供参考。
关键词
小麦;CCT 基因家族;全基因组鉴定;非生物胁迫
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