研究报告

基于转录组鉴定楸子叶片和根系干旱响应基因  

王顺才1* , 李超2 , 马锋旺2 , 王弋博1
1 天水师范学院, 甘肃省农业固体废弃物资源化利用重点实验室, 天水, 741000; 2 西北农林科技大学, 旱区作物逆境生物学国家重点实验室, 杨凌, 712100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2020年06月26日    接受日期: 2020年07月03日    发表日期: 2022年02月17日
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摘要

利用 RNA-Seq 技术研究楸子根、叶组织响应干旱胁迫的差异表达基因(DEGs),为探讨苹果砧木不同组织的抗旱分子机制提供理论依据。结果表明,与对照相比,在干旱胁迫下根、叶组织的基因表达数被抑制。叶片得到 2 211 DEGs,其中 1 128 个上调,1 083 个下调;根系得到 4 996 DEGs,其中 1 810 个上调,3 186 个下调。叶片 DEGs 显著富集于植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢、氨基酸和核苷酸糖代谢以及半乳糖代谢等通路,叶片重要功能基因与 ABA 胁迫响应、IAA 内稳态、肌醇和棉子糖合成关键酶、硝酸根转运蛋白、伸展蛋白、铁蛋白和脱水蛋白等相关。根系 DEGs 显著富集于苯丙烷类生物合成、植物病原菌互作、苯丙氨酸代谢、谷胱甘肽代谢以及萜类(双萜, 倍半萜和三萜)生物合成等通路,重要表达基因与木质素、类胡萝卜和萜类次生代谢物、环核苷酸门控离子通道、钙离子和 MAPK 信号途径等相关。这些干旱响应基因在抗旱反应中可能对维持根、叶组织特异功能起到重要的作用。

关键词
苹果砧木;干旱胁迫;叶片和根系;转录组;差异表达基因

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《分子植物育种》印刷版
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