研究报告

基于 SLAF-seq技术连翘 SNP分子标记开发及遗传多样性分析  

姜涛 , 温春秀 , 田伟 , 谢晓亮 , 卢瑞克 , 温赛群 , 刘灵娣*
河北省农林科学院经济作物研究所,河北省药用植物技术创新中心,石家庄, 050051
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 21 篇   
收稿日期: 2020年06月07日    接受日期: 2020年06月15日    发表日期: 2021年12月12日
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摘要

连翘(Forsythia suspensa (Thunb.) Vahl)是一种极具开发价值的药用植物,本研究利用特异性位点扩增片段测序技术对 39份连翘种质资源进行了分子标记开发,通过测序共获得 112.28 Mb reads数据,各样本 reads数据在 1 324 860~5 911 565之间,样本平均测序质量值 Q3096.29%;平均 GC含量为36.97%。通过生物信息学分析,本研究获得 535 357SLAF标签,样本的平均测序深度为 16.20倍,其中多态性的SLAF标签共有 262 297个,开发获得 1 809 741SNP标记。利用开发的 SNP分子标记将 39份连翘种质资源分为 4组,连翘 SNP分子标记的研究可为连翘种质资源鉴定和遗传多样性分析提供理论基础。

关键词
连翘(Forsythia suspensa (Thunb.) Vahl);SNP;SLAF-seq技术;分子标记

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《分子植物育种》印刷版
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