福建农林大学, 生物农药与化学生物学教育部重点实验室, 福州, 350002
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 20 篇
收稿日期: 2020年06月03日 接受日期: 2020年06月12日 发表日期: 2020年09月17日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 20 篇
收稿日期: 2020年06月03日 接受日期: 2020年06月12日 发表日期: 2020年09月17日
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摘要
本研究利用生物信息学方法对真菌转录因子数据库收录的 17 条禾谷镰刀菌 MYB 转录因子序列进行了分析。基因序列和蛋白理化性质分析发现,禾谷镰刀菌 17 个 MYB 转录因子在核酸长度、蛋白大小、理论等电点、原子总数以及不稳定系数方面均存在差异;基序分析和蛋白二级、三级结构预测发现,这些转录因子包含 2 条特征基序,蛋白空间结构多样且均包含 MYB 转录因子特征结构(螺旋 - 转角 - 螺旋(HTH));系统进化树分析表明,17 个禾谷镰刀菌 MYB 转录因子与 12 个已报道的其他物种 MYB 转录因子进化出两个大的分支,其中 FgMYB03、FgMYB04、FgMYB05、FgMYB06、FgMYB10、FgMYB12 和 FgMYB13 与已知功能的动物、植物和真菌 MYB 转录因子 c-MYB、ATMYB2、MoMyb1、FlbD 和 Pol5 等具有较近的亲缘关系,推测它们具有类似的生物学功能。本研究结果为进一步研究禾谷镰刀菌 MYB 转录因子的生物学功能以及其他真菌 MYB 转录因子的家族特征提供了依据。
关键词
MYB 转录因子;禾谷镰刀菌;生物信息学分析
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