研究报告

灵武长枣嫁接和根蘖繁殖植株果实转录组差异分析  

马亚平1,3 , 白琳云1 , 徐伟荣1,2 , 曹兵1* , 赵思明1 , 宋丽华1 , 刘嘉佳1
1宁夏大学农学院,银川, 750021; 2宁夏大学食品与葡萄酒学院,银川, 750021; 3南京林业大学林学院,南京, 210037
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2020年06月03日    接受日期: 2020年06月12日    发表日期: 2021年12月11日
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摘要

为解析嫁接繁殖和根蘖繁殖灵武长枣果实糖和酸转化差异,本研究以两种繁殖方式的成熟期果实为材料,利用高通量测序平台 Illumina/Nova-Seq 2500进行了转录组测序,对转录组数据质量评估获得两样品的序列长度分别为 24.48 Gb (嫁接)28.64 Gb (根蘖),错误率为 0.03%GC含量 44.11%~44.56%Q30大于 90.54%,转录组数据与冬枣基因组序列比对,所有的转录组 Reads均分布于冬枣 12条染色体上,基因定位的 Reads数量嫁接繁殖比根蘖繁殖多;差异表达基因分析筛选到 27个显著差异表达基因,其中 9个显著上调,18个显著下调;GO富集分析表明 15个差异基因显著富集到 GO的三大功能类别分子功能、细胞组分、生物过程中;KEGG富集分析表明 10个差异表达基因显著富集到 12条代谢通路中,其中包括 3个上调基因和 7个下调基因;进一步筛选到调控糖及有机酸代谢关键差异基因BAM1PCO HAOX1 在淀粉和蔗糖代谢、牛胆素和亚牛磺酸代谢、乙醛酸和二羧酸代谢中显著表达,并在糖和有机酸的相互转化中起着关键调控作用。本研究表明嫁接繁殖和根蘖繁殖灵武长枣果实在糖和有机酸代谢存在差异,为灵武长枣优质果品繁育提供理论基础。

关键词
灵武长枣;转录组;糖代谢;有机酸代谢;差异表达基因

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《分子植物育种》印刷版
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