黄宝华¹ , 蔡家珍¹ , 张梓浩² , 林玉玲² , 赖钟雄^2**

1 漳州职业技术学院食品工程学院, 漳洲, 363000; 2 福建农林大学, 园艺植物生物工程研究所, 福州, 350002
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2020年06月01日    接受日期: 2020年06月11日    发表日期: 2021年03月14日

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本研究利用 Illumina 高通量测序技术对 PP333 处理的朱顶红进行了 RNA-seq 测序，共获得 26.91 Gb的数据，对其进行过滤去冗余后得到 Unigene 106 684 个，总长度为 92 002 803 bp，平均长度为 862 bp，N50为 1 494 bp，GC 含量为 42.47 %，Q20 均达 98%以上，表明测序质量较好。根据七大功能数据库比对结果，分别有 53 853 (NR: 50.48%)、29 732 (NT: 27.87%)、35 889 (SwissProt: 33.64%)、42 221 (KOG: 39.58%)、40 258(KEGG: 37.74%)、12 186 (GO: 11.42%)以及 42 559 (InterPro: 39.89%)个 Unigene 获得功能注释。根据 Nr 注释结果，可匹配到物种为油棕、海枣、小果野芭蕉、莲等。在 KOG 注释中通用功能和预测占比最高。按 GO 功能分类，可分为生物过程、细胞组成、分子功能三类，52 个分支，大量 Unigene 与代谢过程、细胞过程及单生物过程相关。按照 KEGG 功能分类，分为 6 类，21 个功能组，大量 Unigene 与代谢相关，占比 60.39%。本研究结果为朱顶红的矮化机理研究及其基因挖掘提供依据
 

朱顶红(Hippeastrum vittatum)； 转录组； De novo； 功能注释