王柱华¹ , 杨子祥² , 苏帆¹ , 何孟兰¹ , 毛清源¹ , 万琼莲³ , 王连春³ , 蔡红^1*

1云南农业大学,农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室,昆明, 650201; 2云南省农业科学院热区生态农业研究所,元谋, 651300;3玉溪师范学院化学生物与环境学院,玉溪, 653100
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 16 篇   
收稿日期: 2020年06月01日    接受日期: 2020年06月12日    发表日期: 2022年01月04日

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为了从亚组水平上明确云南元谋县的蔓草虫豆丛枝植原体的分类地位，本研究以 rp(II)F1/ rp(II)R1为引物，利用 PCR对感病蔓草虫豆总 DNA进行rp 基因扩增。扩增产物进行序列分析和编码蛋白特性预测，并通过生物信息学软件对rp 基因编码的 rpl22、rps3蛋白特性进行分析。结果表明，PCR扩增测序得到1 171 bp的特异性片段，该片段包括全部rpl22 基因和大部分rps3 基因，两基因相互重叠，分别编码 128和237个氨基酸。通过同源性比对及系统进化树分析，从亚组水平明确了蔓草虫豆丛枝植原体是 16SrII-A亚组成员，且归属于 rp-iii亚进化支。预测rp 基因所编码的 rpl22和 rps3蛋白均为脂溶性蛋白，且二级结构包括螺旋、卷曲和折叠。本研究结果可为深入研究蔓草虫豆丛枝植原体蛋白跨膜运输的分子机理提供一定的理论参考。

蔓草虫豆丛枝植原体；rp 基因；序列分析；结构预测