长江师范学院现代农业与生物工程学院,涪陵, 408100
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 5 篇
收稿日期: 2020年06月01日 接受日期: 2020年06月08日 发表日期: 2021年12月11日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 5 篇
收稿日期: 2020年06月01日 接受日期: 2020年06月08日 发表日期: 2021年12月11日
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摘要
生长素在植物生长发育过程中具有多方面的调控作用,生长素受体是生长素信号分子通路的关键组分之一,但目前对大白菜中生长素受体基因相关研究未见报道。本研究在白菜基因组中共鉴定到 10个TIR1/AFB (Transport inhibitor response 1/auxin signaling F-box protein)生长素受体基因家族成员,在系统进化树上可聚类为 6个分支,并依据其与拟南芥 TIR1/AFB家族基因的系统发育进化关系命名为BrTIR1/AFBs。基因染色体定位分析结果表明,这 10个BrTIR1/AFB 基因分于白菜基因组 10条染色体中的 7条;外显子 -内含子结构分析表明,除BrTIR1C 以外,其余基因结构均相似;蛋白结构域分析结果表明,全部 BrTIR1/AFB蛋白均含有 AMN1结构域,而仅 BrTIR1、BrAFB1、BrAFB2和 BrAFB3蛋白含有 F-box结构域;启动子顺式作用元件分析结果表明,BrTIR1/AFBs 启动子含有与生长素、脱落酸、水杨酸以及响应逆境胁迫相关的多个顺式作用元件。通过 RT-qPCR分析发现 BrTIR1/AFB家族基因组织表达水平存在差异,BrAFB1A、BrAFB1B、BrAFB3A、BrAFB4 受盐胁迫诱导表达,BrTIR1A、BrTIR1C 和BrAFB3B 受根肿菌侵染诱导表达。研究结果可为进一步研究白菜生长素受体基因功能及白菜响应生物及非生物逆境胁迫提供依据。
关键词
白菜(Brassica rapa);生长素受体;TIR1/AFB;基因表达模式;逆境胁迫
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