研究报告

全基因组鉴定和分析水稻 AP2基因家族  

黄霞*,** , 柯笑楠* , 胡海超 , 郭文萍 , 蒋小玥 , 潘项健
浙江农林大学农业与食品科学学院,杭州, 311300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2020年05月26日    接受日期: 2020年05月29日    发表日期: 2021年07月19日
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摘要

AP2亚组类转录因子是植物特有的一类转录因子,属于 AP2/ERF基因家族,在植物生长发育、细胞分化以及响应生物和非生物胁迫过程中起着重要的作用。本研究通过生物信息学的方式共鉴定到 16个水稻AP2 基因,并对这些基因的理化性质、基因结构、进化途径、顺式调控元件、表达谱等方面进行分析。结果显示这些基因不均匀地分布在 8条染色体上,根据同源性差异又可以分成 3个亚组。每个亚组成员在基因结构以及保守基序的位置和数目上具有相似性,而且大部分OsAP2 基因受到一个或者多个 miRNA基因的调控。另一方面,这些基因在不同组织的表达水平有很大的差异,其中茎和花药中表达量相对较高,且部分OsAP2 基因的表达量受到激素的诱导。这些结果为下一步研究水稻AP2 基因的生物学功能打下坚实的基础。
 

关键词
AP2转录因子;进化树;表达谱;顺式作用元件;miRNA

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《分子植物育种》印刷版
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