何旭东¹ , 郑纪伟^1,2 , 何开跃² , 王保松¹

1 江苏省林业科学研究院, 南京, 211153;
2 南京林业大学森林环境与资源学院, 南京, 210037
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13 卷, 第 26 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.000197
收稿日期: 2014年04月25日    接受日期: 2014年07月10日    发表日期: 2014年07月25日

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在SSR标记开发中，合适的位点检索工具是获取位点信息、保障位点准确度及提高开发效率的关键。本研究选取了国内外文献中常用的11种基于Windows系统或在线形式的检索工具对垂柳Unigene序列进行SSR位点检索，比较了不同检索工具的参数设置、使用方式、数据录入量、运行时间、位点统计信息量及位点准确度。经综合对比，检索工具MISA位点检出率及准确度最高，结果统计信息最为丰富；检索工具SSR Locator位点检出率比MISA略低，但操作相对简单，运行时间短，且能对候选位点进行引物设计并模拟PCR反应。因此，推荐MISA和SSR Locator为微卫星位点检索的首选工具。

微卫星；微卫星位点；检索工具；柳树