卓维¹ , 刘艳¹ , 白娟² , 向蓉³ , 卢圣鄂¹ , 任风鸣^1*

1重庆市药物种植研究所,重庆, 408435; 2重庆市渝北区经济作物技术推广站,重庆, 401120; 3云阳县赛凤农业开发有限公司,重庆, 404500
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2020年05月14日    接受日期: 2020年05月18日    发表日期: 2021年07月23日

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为评价 nrDNA ITS序列对榧树属(Torreya)植物的鉴定能力，本研究利用 ITS序列和 4种不同的分析方法(BLAST比对, K2P遗传距离, SNP位点分析及邻近 NJ树)对榧树属植物进行物种鉴定，建立系统进化树讨论其亲缘关系。结果显示，48条 ITS序列长度为 1 095~1 105 bp，种内平均遗传距离为 0.001 6，种间平均遗传距离为 0.015 0。在物种水平，BLAST比对和 NJ树对榧树属植物鉴定效率最高，SNP位点分析可有效鉴定香榧和榧树。亲缘关系分析显示，榧树属其他各种均呈单系分支，但云南榧树与巴山榧树在聚类树中聚为一支，表明二者亲缘关系极近，为近年提出云南榧树并入巴山榧树提供了核基因组序列的佐证。本研究表明 ITS序列可作为榧树属物种鉴定的 DNA条形码，为榧树属物种鉴定和系统关系提供参考。
 

DNA条形码；榧树属；ITS序列；鉴定