1河南科技学院生命科技学院,现代生物育种河南省协同创新中心,河南省棉麦分子生态与种质创新重点实验室,新乡, 453003; 2新疆农业科学院经济作物研究所,乌鲁木齐, 830091
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 6 篇
收稿日期: 2020年05月08日 接受日期: 2020年05月15日 发表日期: 2021年08月15日
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 6 篇
收稿日期: 2020年05月08日 接受日期: 2020年05月15日 发表日期: 2021年08月15日
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摘要
NF-YA家族基因在植物生长发育过程中发挥重要作用,如调控种子发育和种子萌发,响应干旱和盐胁迫等。本研究利用生物信息学手段从亚洲棉全基因组鉴定 NF-YA家族基因,并从理化性质、基因的内含子和外显子结构、氨基酸序列的功能结构域、系统进化发育特征、在染色体的分布和表达模式等方面分析了该家族基因的特征。结果表明:GaNF-YA包含 15个成员,分布在 9条染色体上,编码蛋白质长度为 160~1 079个氨基酸,相对分子质量为 17.92~120.30 kD,包含外显子 4~6个,为碱性。亚洲棉NF-YA 基因可分为三组,且三组NF-YA 基因结构存在差异,保守基序分析其均含有 A1和 A2结构域。通过对启动子顺式作用元件和表达谱分析,推测GaNF-YA 基因可能在棉花种子和纤维形成、种子萌发及环境胁迫等中具有重要作用。本研究为进一步解析亚洲棉 NF-YA家族基因的功能提供理论依据。
关键词
亚洲棉(Gossypium arboretum L.);核因子 Y;基因家族;生物信息学;表达模式
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