研究报告

菠萝蜜 BRI1 家族成员生物信息学的预测与对比  

杨欣蓉1 , 于旭东1 , 吴繁花2* , 蔡泽坪1 , 罗佳佳3,4 , 曹佩娜1
1 海南大学林学院, 热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室, 海口, 570228; 2 海南大学生命科学与药学院, 海口, 570228; 3 海南大学热带作物学院, 海口, 570228; 4 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 农业部热带作物种质资源利用重点开放实验室, 儋州,571737
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2020年04月28日    接受日期: 2020年05月05日    发表日期: 2021年01月26日
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摘要

菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)是热带地区常见的木本植物之一,具有较高的经济和科研价值。本研究采用已完成菠萝蜜幼苗茎叶的全长转录组测序(PRJNA579273),在此基础上对菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus) BR INSENSITIVE 1 (BRI1)家族成员 AhBRI1AhBRL1 AhBRL2 进行生物学信息分析,将基因翻译成蛋白。以菠萝蜜为主,将其与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、川桑(Morus notabilis)和毛果杨(Populus trichocarpa)利用在线分析工具分析得到不同的理化性质数据以及蛋白的二、三级结构。得到不同物种 BRI1蛋白家族之间生物信息学的预测与对比。结果表明,其氨基酸残基数分别为 1 1951 170 985,理论等电点为 6.325.77 7.08,蛋白呈弱酸性,具有一定亲水性,较为稳定;存在分泌途径信号肽或叶绿体转运肽,具有跨膜结构;二级结构主要元件为无规则卷曲和 - 螺旋,三级结构为螺旋管状结构。本研究为进一步对菠萝蜜 BRI1 蛋白家族成员的功能研究提供依据。

关键词
菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus);BRI1;蛋白家族

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《分子植物育种》印刷版
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