研究报告

基于雌雄花序表达谱测序的板栗 SSR 标记开发及其应用  

邱文明 , 徐育海 , 何秀娟 , 仝铸 , 肖翠 , 张娜 , 孙中海*
湖北省农业科学院果树茶叶研究所, 湖北省农业科技创新中心果树茶叶研究分中心, 武汉, 430064
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2020年03月31日    接受日期: 2020年04月10日    发表日期: 2020年08月27日
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摘要

本研究基于板栗雌雄花差异表达谱数据库,筛选鉴定到雌雄花特异表达基因,在雌雄花特异表达基因中识别和定位了 19 SSR 位点。通过在 SSR 两端设计特异引物,经过 PCR 扩增,筛选到 5 对多态性和稳定性较好的引物。进一步采用毛细管电泳检测技术对 17 份板栗资源进行亲缘关系分析。结果显示 17 个品种可分为 3 大类,其中第Ⅰ类群包含‘超短枝 1 号’、‘超短枝 2 号’、‘沂蒙短枝’、‘燕红’等 6 个品种,主要为北方板栗品种;第Ⅱ类群中包含 10 份资源,主要为包括湖北地方品种在内的南方板栗品种;第Ⅲ类仅包括‘金栗王’,与前两大类亲缘关系明显较远。本研究开发的 SSR 分子标记重复性和多态性较高,可用于板栗资源遗传多样性分析,并为开发板栗雌雄花特异分子标记提供科学依据。
 

关键词
板栗;表达谱测序;SSR;毛细管电泳

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《分子植物育种》印刷版
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