研究报告

牡丹试管苗生根前后的转录组分析  

符真珠1 , 徐梦岚1,2 , 袁欣1 , 王慧娟1 , 李艳敏1 , 张和臣1*
1河南省农业科学院园艺研究所,郑州, 450002; 2河南农业大学林学院,郑州, 450002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2020年03月24日    接受日期: 2020年03月27日    发表日期: 2021年01月20日
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摘要

牡丹试管苗移栽成活率低的主要原因在于试管苗在生根诱导后发生休眠,导致试管苗弱小,严重影响移栽成活率。为了研究试管苗发生生根休眠的分子机理,本研究对试管苗生根前后(生根培养0d15d30d45d)地上部分进行高通量转录组测序,结果显示:测序共获得97.45Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到7.71GbQ30碱基百分比在94.31%以上。组装后共获得43,741Unigene其中长度在1kb以上的Unigene15,830。将所有Unigene在七大数据库NRSwiss-ProtGOCOGKOGeggNOG4.5KEGG中进行功能注释,共获得26,488Unigene的注释结果。通过GO 分类和KEGG Pathway 富集性分析,这些unigene分别归于43 GO 类别和128 代谢途径。不同生根培养时期差异表达基因分析显示,生根培养15d较生根培养前,有1416个基因上调,1170个基因下调;生根培养30d较生根培养15d,有1961个基因上调,1344个基因下调;而生根培养45d较生根培养30d,只有201个基因上调,367个基因下调。这些差异表达基因在KEGG生物通路中,以参与能量物质代谢、植物激素信号转导及次生物质合成等代谢途径富集显著。本研究为进一步挖掘试管苗发生生根休眠的相关调控基因提供理论依据。

关键词
牡丹;试管苗;休眠;转录组

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《分子植物育种》印刷版
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